Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms