Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM0

CMPK2, UMP-CMP kinase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK2Q5EBM0 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CMPK2Q5EBM0 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CMPK2Q5EBM0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CMPK2Q5EBM0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CMPK2Q5EBM0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CMPK2Q5EBM0 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CMPK2Q5EBM0 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CMPK2Q5EBM0 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CMPK2Q5EBM0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CMPK2Q5EBM0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CMPK2Q5EBM0 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CMPK2Q5EBM0 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CMPK2Q5EBM0 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CMPK2Q5EBM0 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CMPK2Q5EBM0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CMPK2Q5EBM0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CMPK2Q5EBM0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CMPK2Q5EBM0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CMPK2Q5EBM0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CMPK2Q5EBM0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CMPK2Q5EBM0 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CMPK2Q5EBM0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CMPK2Q5EBM0 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CMPK2Q5EBM0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CMPK2Q5EBM0 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CMPK2Q5EBM0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CMPK2Q5EBM0 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CMPK2Q5EBM0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CMPK2Q5EBM0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CMPK2Q5EBM0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CMPK2Q5EBM0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CMPK2Q5EBM0 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CMPK2Q5EBM0 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CMPK2Q5EBM0 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CMPK2Q5EBM0 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CMPK2Q5EBM0 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CMPK2Q5EBM0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CMPK2Q5EBM0 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CMPK2Q5EBM0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CMPK2Q5EBM0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CMPK2Q5EBM0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CMPK2Q5EBM0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CMPK2Q5EBM0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CMPK2Q5EBM0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CMPK2Q5EBM0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CMPK2Q5EBM0 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CMPK2Q5EBM0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CMPK2Q5EBM0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CMPK2Q5EBM0 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CMPK2Q5EBM0 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CMPK2Q5EBM0 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CMPK2Q5EBM0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CMPK2Q5EBM0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CMPK2Q5EBM0 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CMPK2Q5EBM0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CMPK2Q5EBM0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CMPK2Q5EBM0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CMPK2Q5EBM0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CMPK2Q5EBM0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CMPK2Q5EBM0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CMPK2Q5EBM0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CMPK2Q5EBM0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CMPK2Q5EBM0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CMPK2Q5EBM0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CMPK2Q5EBM0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CMPK2Q5EBM0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CMPK2Q5EBM0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CMPK2Q5EBM0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CMPK2Q5EBM0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CMPK2Q5EBM0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CMPK2Q5EBM0 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CMPK2Q5EBM0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CMPK2Q5EBM0 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CMPK2Q5EBM0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CMPK2Q5EBM0 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CMPK2Q5EBM0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CMPK2Q5EBM0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CMPK2Q5EBM0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CMPK2Q5EBM0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CMPK2Q5EBM0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CMPK2Q5EBM0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CMPK2Q5EBM0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CMPK2Q5EBM0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CMPK2Q5EBM0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CMPK2Q5EBM0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CMPK2Q5EBM0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CMPK2Q5EBM0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CMPK2Q5EBM0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CMPK2Q5EBM0 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CMPK2Q5EBM0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CMPK2Q5EBM0 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CMPK2Q5EBM0 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CMPK2Q5EBM0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CMPK2Q5EBM0 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CMPK2Q5EBM0 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CMPK2Q5EBM0 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CMPK2Q5EBM0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CMPK2Q5EBM0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CMPK2Q5EBM0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CMPK2Q5EBM0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms