Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM259Q4ZIN3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms