Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms