Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAPTM4AQ15012 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms