Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HERPUD1Q15011 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HERPUD1Q15011 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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