Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GTF2H3Q13889 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2H3Q13889 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
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