Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA7Q13683 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA7Q13683 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA7Q13683 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA7Q13683 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA7Q13683 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA7Q13683 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA7Q13683 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA7Q13683 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA7Q13683 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA7Q13683 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA7Q13683 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA7Q13683 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA7Q13683 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA7Q13683 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA7Q13683 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
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