Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PMS2P11Q13670 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PMS2P11Q13670 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PMS2P11Q13670 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PMS2P11Q13670 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PMS2P11Q13670 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P11Q13670 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P11Q13670 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P11Q13670 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P11Q13670 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P11Q13670 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P11Q13670 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P11Q13670 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P11Q13670 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P11Q13670 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P11Q13670 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P11Q13670 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P11Q13670 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P11Q13670 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P11Q13670 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P11Q13670 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P11Q13670 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P11Q13670 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P11Q13670 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P11Q13670 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P11Q13670 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P11Q13670 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P11Q13670 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P11Q13670 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P11Q13670 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P11Q13670 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P11Q13670 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P11Q13670 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P11Q13670 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P11Q13670 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P11Q13670 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P11Q13670 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P11Q13670 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PMS2P11Q13670 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PMS2P11Q13670 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PMS2P11Q13670 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PMS2P11Q13670 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PMS2P11Q13670 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PMS2P11Q13670 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PMS2P11Q13670 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PMS2P11Q13670 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PMS2P11Q13670 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PMS2P11Q13670 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms