Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 CAPN1-220ENST00000530567 1415 ntTSL 226.43■■□□□ 1.828e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 UBA2-203ENST00000586313 1458 ntTSL 226.41■■□□□ 1.828e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 RANBP1-213ENST00000486575 2177 ntTSL 225.73■■□□□ 1.718e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 PSME3-211ENST00000591152 1018 ntTSL 325.53■■□□□ 1.688e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 STARD10-216ENST00000542989 839 ntTSL 325.32■■□□□ 1.648e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 PSME3-207ENST00000586114 580 ntTSL 425.31■■□□□ 1.648e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.68e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 PTOV1-211ENST00000598632 1073 ntTSL 224.92■■□□□ 1.588e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 PSME3-209ENST00000589469 733 ntTSL 324.85■■□□□ 1.578e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 UBE2K-206ENST00000510934 589 ntTSL 224.82■■□□□ 1.568e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.488e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.488e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 PUF60-219ENST00000532127 604 ntTSL 224.2■■□□□ 1.468e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 RANBP1-210ENST00000435265 1879 ntTSL 224.17■■□□□ 1.468e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.438e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 STARD10-212ENST00000538437 747 ntTSL 223.82■■□□□ 1.48e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.48e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.398e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 PTOV1-203ENST00000594165 986 ntTSL 323.69■■□□□ 1.388e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.388e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 PSME3-206ENST00000585805 1364 ntTSL 1 (best)23.6■■□□□ 1.378e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.358e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.338e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.328e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.319e-8■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 MED24-221ENST00000580008 957 ntTSL 1 (best)23.07■■□□□ 1.288e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 UBE2K-202ENST00000438068 2262 ntTSL 222.81■■□□□ 1.248e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 CORO1B-204ENST00000537042 1954 ntTSL 522.8■■□□□ 1.248e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 RANBP1-207ENST00000423859 832 ntTSL 322.72■■□□□ 1.238e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.28e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 GNPAT-203ENST00000436239 839 ntAPPRIS ALT2 TSL 322.05■■□□□ 1.128e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 PSME3-216ENST00000593111 552 ntTSL 421.54■■□□□ 1.048e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 STARD10-217ENST00000543089 506 ntTSL 1 (best)21.45■■□□□ 1.028e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 CORO1B-205ENST00000539724 615 ntTSL 320.88■□□□□ 0.938e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 PSMD4-212ENST00000491857 461 ntTSL 220.83■□□□□ 0.932e-7■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 LMNB2-202ENST00000475819 885 ntTSL 520.7■□□□□ 0.98e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 RANBP1-205ENST00000418705 932 ntTSL 320.47■□□□□ 0.878e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.838e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 PTOV1-217ENST00000601501 564 ntTSL 220.08■□□□□ 0.818e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 MED24-206ENST00000428757 1105 ntTSL 519.96■□□□□ 0.798e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 GNPAT-202ENST00000416000 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 519.87■□□□□ 0.778e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.768e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 STARD10-219ENST00000544767 509 ntTSL 319.62■□□□□ 0.738e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.699e-8■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 MED24-233ENST00000585306 597 ntTSL 419.37■□□□□ 0.698e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 TSN-205ENST00000478165 578 ntTSL 319.28■□□□□ 0.688e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 TSN-209ENST00000490717 560 ntTSL 419.28■□□□□ 0.688e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 TSN-211ENST00000498545 1118 ntTSL 1 (best)19.28■□□□□ 0.688e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 CDC37-205ENST00000589625 587 ntTSL 219.21■□□□□ 0.678e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 TSN-203ENST00000455432 555 ntTSL 418.84■□□□□ 0.618e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.598e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.58e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 PUF60-206ENST00000526151 557 ntTSL 317.99■□□□□ 0.478e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 RANBP1-211ENST00000448394 688 ntTSL 217.97■□□□□ 0.478e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.468e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.418e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 PTOV1-202ENST00000594151 995 ntTSL 517.42■□□□□ 0.388e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.378e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 STARD10-202ENST00000400925 541 ntTSL 217.26■□□□□ 0.358e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 MYO1C-211ENST00000573198 582 ntTSL 317.25■□□□□ 0.358e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 FADS2-204ENST00000517312 588 ntTSL 517.23■□□□□ 0.359e-8■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 TSN-208ENST00000490104 2717 ntTSL 217.22■□□□□ 0.358e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 CAPN1-214ENST00000528165 2828 ntTSL 217.14■□□□□ 0.338e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 PSME3-208ENST00000586312 752 ntTSL 517.01■□□□□ 0.318e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.38e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 PTOV1-221ENST00000602040 597 ntTSL 216.84■□□□□ 0.298e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 WDR36-202ENST00000505303 2126 ntTSL 516.8■□□□□ 0.288e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.278e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.268e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 YTHDF3-208ENST00000615676 5092 ntTSL 1 (best)16.66■□□□□ 0.268e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.258e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.238e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 WBP2-209ENST00000589236 747 ntTSL 216.41■□□□□ 0.228e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 TSN-204ENST00000467324 2843 ntTSL 516.18■□□□□ 0.188e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 USP14-208ENST00000582707 1803 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.168e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 CORO1B-209ENST00000616321 4464 ntTSL 216.05■□□□□ 0.168e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.138e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 GLO1-201ENST00000373365 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.128e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 VAPB-203ENST00000463370 2393 ntTSL 215.68■□□□□ 0.18e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 TSN-201ENST00000389682 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.088e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 PTOV1-206ENST00000596095 734 ntTSL 315.53■□□□□ 0.088e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 PSME3-217ENST00000622892 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.048e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 MCM3AP-206ENST00000481113 570 ntTSL 215.23■□□□□ 0.038e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 TSN-202ENST00000409193 1436 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.048e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 USP14-202ENST00000383589 2168 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.088e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 MED24-216ENST00000543759 628 ntTSL 414.44□□□□□ -0.18e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 PSME3-213ENST00000592169 826 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.18e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 MYO1C-209ENST00000571851 553 ntTSL 514.05□□□□□ -0.168e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 USP14-203ENST00000400266 1681 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.178e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 VAPB-204ENST00000475243 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.278e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 KIAA1671-201ENST00000358431 10490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.298e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 PSME3-205ENST00000545225 3082 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.318e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 WDR36-206ENST00000612402 6592 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.318e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 WDR36-203ENST00000506538 7048 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.328e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 USP14-205ENST00000578942 3189 ntTSL 212.97□□□□□ -0.338e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 STOML2-204ENST00000488050 904 ntTSL 512.66□□□□□ -0.388e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 KIAA1671-203ENST00000406486 7864 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.398e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 PSME3-201ENST00000293362 3144 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.428e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 KIAA1671-205ENST00000494730 6082 ntTSL 1 (best)12.37□□□□□ -0.438e-6■■□□□ 11.5
G3BP1Q13283 KIF1B-205ENST00000377093 7565 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.458e-6■■□□□ 11.5
Retrieved 100 of 11,245 protein–RNA pairs in 109.2 ms