Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRSF6Q13247 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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