Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTP4A2Q12974 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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PTP4A2Q12974 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
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PTP4A2Q12974 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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PTP4A2Q12974 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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PTP4A2Q12974 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
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PTP4A2Q12974 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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PTP4A2Q12974 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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PTP4A2Q12974 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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PTP4A2Q12974 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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PTP4A2Q12974 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTP4A2Q12974 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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