Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFEMP1Q12805 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFEMP1Q12805 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
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