Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD300CQ08708 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD300CQ08708 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD300CQ08708 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD300CQ08708 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD300CQ08708 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD300CQ08708 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD300CQ08708 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD300CQ08708 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD300CQ08708 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD300CQ08708 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD300CQ08708 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD300CQ08708 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD300CQ08708 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD300CQ08708 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CD300CQ08708 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD300CQ08708 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD300CQ08708 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD300CQ08708 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD300CQ08708 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CD300CQ08708 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD300CQ08708 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD300CQ08708 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD300CQ08708 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD300CQ08708 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD300CQ08708 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD300CQ08708 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD300CQ08708 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD300CQ08708 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD300CQ08708 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD300CQ08708 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CD300CQ08708 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD300CQ08708 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD300CQ08708 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD300CQ08708 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms