Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAD51Q06609 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms