Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHRNEQ04844 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms