Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GBE1Q04446 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms