Protein–RNA interactions for Protein: Q03519

TAP2, Antigen peptide transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP2Q03519 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TAP2Q03519 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms