Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms