Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFITM3Q01628 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms