Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SUMO1P63165 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SUMO1P63165 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms