Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFC1-1P60608 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms