Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
UBASH3AP57075 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBASH3AP57075 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms