Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SH3BGRP55822 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
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