Protein–RNA interactions for Protein: P55083

MFAP4, Microfibril-associated glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFAP4P55083 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MFAP4P55083 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MFAP4P55083 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms