Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
COPAP53621 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
COPAP53621 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
COPAP53621 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
COPAP53621 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
COPAP53621 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COPAP53621 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COPAP53621 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COPAP53621 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COPAP53621 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COPAP53621 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COPAP53621 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COPAP53621 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COPAP53621 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COPAP53621 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COPAP53621 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COPAP53621 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COPAP53621 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COPAP53621 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COPAP53621 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COPAP53621 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COPAP53621 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COPAP53621 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COPAP53621 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
COPAP53621 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COPAP53621 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COPAP53621 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COPAP53621 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COPAP53621 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COPAP53621 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COPAP53621 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COPAP53621 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COPAP53621 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COPAP53621 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COPAP53621 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COPAP53621 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COPAP53621 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COPAP53621 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COPAP53621 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COPAP53621 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COPAP53621 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COPAP53621 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COPAP53621 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COPAP53621 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COPAP53621 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COPAP53621 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COPAP53621 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COPAP53621 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COPAP53621 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COPAP53621 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COPAP53621 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COPAP53621 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COPAP53621 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COPAP53621 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COPAP53621 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COPAP53621 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COPAP53621 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COPAP53621 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COPAP53621 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COPAP53621 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COPAP53621 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COPAP53621 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COPAP53621 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COPAP53621 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COPAP53621 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COPAP53621 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COPAP53621 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COPAP53621 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COPAP53621 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COPAP53621 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COPAP53621 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COPAP53621 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COPAP53621 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COPAP53621 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COPAP53621 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COPAP53621 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COPAP53621 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COPAP53621 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COPAP53621 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COPAP53621 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COPAP53621 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COPAP53621 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COPAP53621 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COPAP53621 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COPAP53621 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
COPAP53621 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COPAP53621 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COPAP53621 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COPAP53621 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
COPAP53621 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COPAP53621 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COPAP53621 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COPAP53621 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COPAP53621 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COPAP53621 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COPAP53621 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COPAP53621 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COPAP53621 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
COPAP53621 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COPAP53621 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms