Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CLK1P49759 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLK1P49759 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLK1P49759 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLK1P49759 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CLK1P49759 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLK1P49759 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLK1P49759 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLK1P49759 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLK1P49759 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLK1P49759 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLK1P49759 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLK1P49759 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CLK1P49759 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLK1P49759 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLK1P49759 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLK1P49759 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLK1P49759 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLK1P49759 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLK1P49759 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLK1P49759 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CLK1P49759 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CLK1P49759 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CLK1P49759 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLK1P49759 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLK1P49759 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLK1P49759 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLK1P49759 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLK1P49759 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLK1P49759 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLK1P49759 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLK1P49759 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLK1P49759 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLK1P49759 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLK1P49759 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLK1P49759 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLK1P49759 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLK1P49759 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLK1P49759 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLK1P49759 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLK1P49759 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLK1P49759 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CLK1P49759 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CLK1P49759 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CLK1P49759 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CLK1P49759 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLK1P49759 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLK1P49759 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLK1P49759 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLK1P49759 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLK1P49759 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLK1P49759 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLK1P49759 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLK1P49759 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLK1P49759 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLK1P49759 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLK1P49759 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLK1P49759 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLK1P49759 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLK1P49759 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLK1P49759 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLK1P49759 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLK1P49759 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLK1P49759 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLK1P49759 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLK1P49759 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLK1P49759 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CLK1P49759 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLK1P49759 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLK1P49759 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLK1P49759 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLK1P49759 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLK1P49759 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLK1P49759 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLK1P49759 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLK1P49759 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLK1P49759 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLK1P49759 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLK1P49759 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLK1P49759 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLK1P49759 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLK1P49759 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLK1P49759 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLK1P49759 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLK1P49759 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLK1P49759 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLK1P49759 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLK1P49759 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLK1P49759 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLK1P49759 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLK1P49759 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLK1P49759 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLK1P49759 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLK1P49759 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLK1P49759 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLK1P49759 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLK1P49759 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLK1P49759 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLK1P49759 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLK1P49759 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms