Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTGIRP43119 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
PTGIRP43119 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTGIRP43119 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTGIRP43119 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTGIRP43119 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTGIRP43119 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTGIRP43119 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTGIRP43119 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTGIRP43119 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTGIRP43119 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTGIRP43119 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTGIRP43119 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTGIRP43119 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTGIRP43119 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PTGIRP43119 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTGIRP43119 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTGIRP43119 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTGIRP43119 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTGIRP43119 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTGIRP43119 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTGIRP43119 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTGIRP43119 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTGIRP43119 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTGIRP43119 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTGIRP43119 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTGIRP43119 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTGIRP43119 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTGIRP43119 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTGIRP43119 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTGIRP43119 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTGIRP43119 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTGIRP43119 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTGIRP43119 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTGIRP43119 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTGIRP43119 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTGIRP43119 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTGIRP43119 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTGIRP43119 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTGIRP43119 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTGIRP43119 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTGIRP43119 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTGIRP43119 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTGIRP43119 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTGIRP43119 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTGIRP43119 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTGIRP43119 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTGIRP43119 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTGIRP43119 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTGIRP43119 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PTGIRP43119 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PTGIRP43119 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTGIRP43119 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTGIRP43119 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTGIRP43119 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PTGIRP43119 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTGIRP43119 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTGIRP43119 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTGIRP43119 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PTGIRP43119 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTGIRP43119 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTGIRP43119 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTGIRP43119 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms