Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGDSP41222 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms