Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GGCXP38435 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GGCXP38435 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GGCXP38435 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GGCXP38435 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GGCXP38435 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GGCXP38435 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GGCXP38435 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GGCXP38435 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GGCXP38435 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GGCXP38435 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GGCXP38435 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GGCXP38435 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GGCXP38435 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GGCXP38435 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GGCXP38435 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GGCXP38435 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GGCXP38435 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GGCXP38435 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GGCXP38435 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GGCXP38435 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GGCXP38435 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GGCXP38435 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GGCXP38435 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GGCXP38435 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GGCXP38435 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GGCXP38435 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GGCXP38435 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GGCXP38435 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GGCXP38435 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GGCXP38435 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GGCXP38435 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GGCXP38435 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GGCXP38435 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GGCXP38435 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GGCXP38435 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GGCXP38435 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GGCXP38435 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GGCXP38435 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GGCXP38435 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GGCXP38435 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GGCXP38435 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GGCXP38435 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GGCXP38435 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GGCXP38435 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GGCXP38435 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GGCXP38435 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GGCXP38435 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GGCXP38435 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GGCXP38435 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GGCXP38435 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GGCXP38435 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GGCXP38435 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GGCXP38435 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GGCXP38435 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GGCXP38435 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GGCXP38435 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GGCXP38435 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GGCXP38435 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GGCXP38435 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GGCXP38435 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GGCXP38435 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GGCXP38435 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GGCXP38435 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GGCXP38435 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GGCXP38435 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GGCXP38435 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GGCXP38435 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GGCXP38435 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GGCXP38435 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GGCXP38435 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GGCXP38435 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GGCXP38435 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GGCXP38435 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GGCXP38435 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GGCXP38435 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GGCXP38435 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GGCXP38435 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GGCXP38435 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GGCXP38435 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GGCXP38435 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GGCXP38435 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GGCXP38435 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GGCXP38435 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GGCXP38435 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GGCXP38435 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GGCXP38435 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GGCXP38435 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GGCXP38435 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GGCXP38435 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GGCXP38435 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
GGCXP38435 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
GGCXP38435 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GGCXP38435 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GGCXP38435 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GGCXP38435 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GGCXP38435 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GGCXP38435 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GGCXP38435 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GGCXP38435 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms