Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT2P35908 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT2P35908 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT2P35908 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT2P35908 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT2P35908 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT2P35908 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT2P35908 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT2P35908 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT2P35908 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT2P35908 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT2P35908 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT2P35908 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT2P35908 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT2P35908 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT2P35908 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT2P35908 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT2P35908 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT2P35908 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT2P35908 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT2P35908 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT2P35908 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT2P35908 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT2P35908 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT2P35908 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT2P35908 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT2P35908 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT2P35908 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT2P35908 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT2P35908 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT2P35908 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT2P35908 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT2P35908 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT2P35908 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT2P35908 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT2P35908 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT2P35908 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT2P35908 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT2P35908 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT2P35908 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT2P35908 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT2P35908 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT2P35908 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT2P35908 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT2P35908 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT2P35908 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT2P35908 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT2P35908 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT2P35908 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT2P35908 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT2P35908 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT2P35908 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT2P35908 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT2P35908 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT2P35908 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT2P35908 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT2P35908 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT2P35908 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT2P35908 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT2P35908 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT2P35908 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT2P35908 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT2P35908 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT2P35908 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT2P35908 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT2P35908 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT2P35908 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT2P35908 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT2P35908 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT2P35908 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT2P35908 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT2P35908 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT2P35908 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT2P35908 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT2P35908 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT2P35908 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT2P35908 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT2P35908 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT2P35908 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT2P35908 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT2P35908 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT2P35908 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT2P35908 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT2P35908 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT2P35908 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT2P35908 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT2P35908 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT2P35908 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT2P35908 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT2P35908 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT2P35908 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT2P35908 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT2P35908 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT2P35908 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT2P35908 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT2P35908 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT2P35908 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT2P35908 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT2P35908 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT2P35908 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms