Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SFTPDP35247 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms