Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMO2P25791 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMO2P25791 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMO2P25791 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMO2P25791 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMO2P25791 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMO2P25791 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
LMO2P25791 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMO2P25791 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMO2P25791 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMO2P25791 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMO2P25791 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMO2P25791 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMO2P25791 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMO2P25791 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMO2P25791 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMO2P25791 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMO2P25791 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMO2P25791 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMO2P25791 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMO2P25791 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMO2P25791 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMO2P25791 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMO2P25791 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMO2P25791 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMO2P25791 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMO2P25791 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LMO2P25791 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMO2P25791 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMO2P25791 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMO2P25791 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMO2P25791 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMO2P25791 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMO2P25791 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMO2P25791 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMO2P25791 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMO2P25791 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMO2P25791 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMO2P25791 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMO2P25791 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMO2P25791 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMO2P25791 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMO2P25791 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMO2P25791 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMO2P25791 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMO2P25791 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LMO2P25791 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LMO2P25791 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LMO2P25791 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LMO2P25791 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LMO2P25791 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LMO2P25791 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LMO2P25791 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LMO2P25791 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LMO2P25791 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LMO2P25791 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LMO2P25791 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LMO2P25791 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LMO2P25791 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LMO2P25791 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LMO2P25791 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
LMO2P25791 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
LMO2P25791 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LMO2P25791 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LMO2P25791 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LMO2P25791 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LMO2P25791 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LMO2P25791 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LMO2P25791 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LMO2P25791 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LMO2P25791 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LMO2P25791 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LMO2P25791 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LMO2P25791 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LMO2P25791 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LMO2P25791 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LMO2P25791 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LMO2P25791 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LMO2P25791 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LMO2P25791 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LMO2P25791 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LMO2P25791 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LMO2P25791 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LMO2P25791 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LMO2P25791 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LMO2P25791 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LMO2P25791 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
LMO2P25791 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LMO2P25791 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LMO2P25791 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
LMO2P25791 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LMO2P25791 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LMO2P25791 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LMO2P25791 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LMO2P25791 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
LMO2P25791 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LMO2P25791 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LMO2P25791 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LMO2P25791 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LMO2P25791 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms