Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms