Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCP20941 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCP20941 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCP20941 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCP20941 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCP20941 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCP20941 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCP20941 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCP20941 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCP20941 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCP20941 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCP20941 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCP20941 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCP20941 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCP20941 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCP20941 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCP20941 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCP20941 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCP20941 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCP20941 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCP20941 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCP20941 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCP20941 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCP20941 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCP20941 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCP20941 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCP20941 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCP20941 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCP20941 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCP20941 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCP20941 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCP20941 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCP20941 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCP20941 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCP20941 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCP20941 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCP20941 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCP20941 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCP20941 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDCP20941 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDCP20941 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDCP20941 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDCP20941 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDCP20941 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDCP20941 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDCP20941 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDCP20941 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDCP20941 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDCP20941 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDCP20941 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDCP20941 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PDCP20941 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDCP20941 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDCP20941 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDCP20941 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDCP20941 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDCP20941 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDCP20941 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDCP20941 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDCP20941 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDCP20941 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDCP20941 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDCP20941 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDCP20941 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
PDCP20941 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDCP20941 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDCP20941 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PDCP20941 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDCP20941 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDCP20941 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDCP20941 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDCP20941 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDCP20941 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDCP20941 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDCP20941 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDCP20941 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDCP20941 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDCP20941 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDCP20941 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDCP20941 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDCP20941 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDCP20941 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDCP20941 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDCP20941 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDCP20941 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDCP20941 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDCP20941 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDCP20941 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDCP20941 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDCP20941 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDCP20941 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDCP20941 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDCP20941 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDCP20941 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDCP20941 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDCP20941 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDCP20941 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDCP20941 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDCP20941 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDCP20941 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms