Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SDSP20132 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SDSP20132 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SDSP20132 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SDSP20132 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SDSP20132 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SDSP20132 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SDSP20132 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SDSP20132 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SDSP20132 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SDSP20132 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDSP20132 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDSP20132 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDSP20132 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDSP20132 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDSP20132 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDSP20132 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDSP20132 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDSP20132 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDSP20132 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDSP20132 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDSP20132 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDSP20132 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDSP20132 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDSP20132 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDSP20132 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDSP20132 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDSP20132 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDSP20132 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SDSP20132 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDSP20132 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDSP20132 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDSP20132 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDSP20132 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDSP20132 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDSP20132 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDSP20132 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDSP20132 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDSP20132 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDSP20132 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SDSP20132 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SDSP20132 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SDSP20132 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SDSP20132 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SDSP20132 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SDSP20132 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SDSP20132 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SDSP20132 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SDSP20132 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SDSP20132 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SDSP20132 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SDSP20132 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SDSP20132 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SDSP20132 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
SDSP20132 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SDSP20132 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SDSP20132 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SDSP20132 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SDSP20132 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SDSP20132 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SDSP20132 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SDSP20132 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SDSP20132 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDSP20132 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDSP20132 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDSP20132 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDSP20132 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDSP20132 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDSP20132 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDSP20132 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDSP20132 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDSP20132 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDSP20132 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDSP20132 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDSP20132 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDSP20132 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDSP20132 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDSP20132 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDSP20132 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDSP20132 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDSP20132 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDSP20132 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDSP20132 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDSP20132 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDSP20132 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDSP20132 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDSP20132 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDSP20132 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDSP20132 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDSP20132 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDSP20132 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDSP20132 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDSP20132 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDSP20132 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDSP20132 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDSP20132 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDSP20132 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDSP20132 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDSP20132 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SDSP20132 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms