Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCLP19338 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCLP19338 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCLP19338 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCLP19338 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCLP19338 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCLP19338 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NCLP19338 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCLP19338 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCLP19338 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCLP19338 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCLP19338 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCLP19338 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCLP19338 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCLP19338 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCLP19338 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCLP19338 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCLP19338 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCLP19338 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCLP19338 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCLP19338 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCLP19338 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCLP19338 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCLP19338 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCLP19338 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCLP19338 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCLP19338 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCLP19338 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCLP19338 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCLP19338 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCLP19338 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCLP19338 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCLP19338 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCLP19338 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCLP19338 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCLP19338 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCLP19338 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCLP19338 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCLP19338 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCLP19338 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCLP19338 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCLP19338 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCLP19338 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCLP19338 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCLP19338 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCLP19338 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCLP19338 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCLP19338 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCLP19338 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCLP19338 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCLP19338 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCLP19338 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCLP19338 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCLP19338 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCLP19338 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCLP19338 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCLP19338 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NCLP19338 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NCLP19338 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NCLP19338 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NCLP19338 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NCLP19338 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NCLP19338 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NCLP19338 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NCLP19338 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NCLP19338 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NCLP19338 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NCLP19338 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NCLP19338 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCLP19338 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCLP19338 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCLP19338 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCLP19338 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCLP19338 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCLP19338 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCLP19338 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCLP19338 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCLP19338 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCLP19338 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCLP19338 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCLP19338 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCLP19338 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NCLP19338 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCLP19338 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCLP19338 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCLP19338 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCLP19338 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCLP19338 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCLP19338 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NCLP19338 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCLP19338 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCLP19338 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCLP19338 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCLP19338 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCLP19338 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCLP19338 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCLP19338 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCLP19338 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCLP19338 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NCLP19338 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms