Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DESP17661 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DESP17661 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DESP17661 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DESP17661 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DESP17661 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DESP17661 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DESP17661 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DESP17661 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DESP17661 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DESP17661 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DESP17661 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
DESP17661 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DESP17661 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DESP17661 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DESP17661 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DESP17661 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DESP17661 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DESP17661 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DESP17661 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DESP17661 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
DESP17661 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DESP17661 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DESP17661 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DESP17661 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DESP17661 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DESP17661 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DESP17661 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DESP17661 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DESP17661 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DESP17661 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DESP17661 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DESP17661 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DESP17661 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DESP17661 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
DESP17661 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DESP17661 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
DESP17661 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DESP17661 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DESP17661 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DESP17661 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DESP17661 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DESP17661 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DESP17661 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DESP17661 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DESP17661 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DESP17661 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
DESP17661 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DESP17661 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DESP17661 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DESP17661 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DESP17661 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DESP17661 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DESP17661 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DESP17661 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DESP17661 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DESP17661 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DESP17661 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DESP17661 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DESP17661 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DESP17661 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
DESP17661 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DESP17661 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DESP17661 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DESP17661 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DESP17661 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DESP17661 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DESP17661 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
DESP17661 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DESP17661 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DESP17661 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DESP17661 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DESP17661 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DESP17661 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DESP17661 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DESP17661 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DESP17661 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DESP17661 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DESP17661 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DESP17661 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DESP17661 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DESP17661 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DESP17661 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DESP17661 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DESP17661 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DESP17661 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DESP17661 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DESP17661 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DESP17661 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DESP17661 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
DESP17661 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DESP17661 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
DESP17661 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
DESP17661 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DESP17661 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
DESP17661 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DESP17661 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DESP17661 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DESP17661 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DESP17661 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms