Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF35P13682 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF35P13682 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF35P13682 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF35P13682 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF35P13682 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF35P13682 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF35P13682 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF35P13682 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF35P13682 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF35P13682 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF35P13682 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF35P13682 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF35P13682 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF35P13682 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF35P13682 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF35P13682 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF35P13682 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF35P13682 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF35P13682 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF35P13682 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF35P13682 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF35P13682 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF35P13682 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF35P13682 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF35P13682 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms