Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCG2P13521 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SCG2P13521 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCG2P13521 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCG2P13521 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCG2P13521 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCG2P13521 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCG2P13521 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCG2P13521 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCG2P13521 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCG2P13521 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SCG2P13521 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCG2P13521 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCG2P13521 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCG2P13521 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCG2P13521 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCG2P13521 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCG2P13521 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCG2P13521 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCG2P13521 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCG2P13521 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCG2P13521 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCG2P13521 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCG2P13521 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCG2P13521 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCG2P13521 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCG2P13521 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCG2P13521 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCG2P13521 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCG2P13521 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCG2P13521 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCG2P13521 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SCG2P13521 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCG2P13521 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCG2P13521 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCG2P13521 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCG2P13521 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCG2P13521 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCG2P13521 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCG2P13521 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCG2P13521 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCG2P13521 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCG2P13521 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCG2P13521 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SCG2P13521 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCG2P13521 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCG2P13521 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCG2P13521 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SCG2P13521 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCG2P13521 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCG2P13521 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCG2P13521 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCG2P13521 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCG2P13521 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCG2P13521 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCG2P13521 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SCG2P13521 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SCG2P13521 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCG2P13521 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCG2P13521 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCG2P13521 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCG2P13521 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCG2P13521 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCG2P13521 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCG2P13521 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCG2P13521 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCG2P13521 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCG2P13521 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCG2P13521 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCG2P13521 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCG2P13521 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCG2P13521 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCG2P13521 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCG2P13521 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCG2P13521 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCG2P13521 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCG2P13521 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCG2P13521 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCG2P13521 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCG2P13521 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCG2P13521 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCG2P13521 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCG2P13521 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCG2P13521 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCG2P13521 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCG2P13521 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCG2P13521 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCG2P13521 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCG2P13521 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCG2P13521 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCG2P13521 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCG2P13521 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCG2P13521 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCG2P13521 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCG2P13521 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCG2P13521 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCG2P13521 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCG2P13521 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCG2P13521 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCG2P13521 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms