Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RD3LP0DJH9 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms