Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W0

PRR29, Proline-rich protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR29P0C7W0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRR29P0C7W0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRR29P0C7W0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRR29P0C7W0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRR29P0C7W0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRR29P0C7W0 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRR29P0C7W0 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRR29P0C7W0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRR29P0C7W0 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRR29P0C7W0 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRR29P0C7W0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRR29P0C7W0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRR29P0C7W0 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRR29P0C7W0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRR29P0C7W0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRR29P0C7W0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRR29P0C7W0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRR29P0C7W0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRR29P0C7W0 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRR29P0C7W0 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRR29P0C7W0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRR29P0C7W0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRR29P0C7W0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRR29P0C7W0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRR29P0C7W0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRR29P0C7W0 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRR29P0C7W0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRR29P0C7W0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRR29P0C7W0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRR29P0C7W0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRR29P0C7W0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRR29P0C7W0 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRR29P0C7W0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRR29P0C7W0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRR29P0C7W0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRR29P0C7W0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRR29P0C7W0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRR29P0C7W0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRR29P0C7W0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRR29P0C7W0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRR29P0C7W0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRR29P0C7W0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRR29P0C7W0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRR29P0C7W0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRR29P0C7W0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRR29P0C7W0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRR29P0C7W0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRR29P0C7W0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRR29P0C7W0 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRR29P0C7W0 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRR29P0C7W0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRR29P0C7W0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRR29P0C7W0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRR29P0C7W0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRR29P0C7W0 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRR29P0C7W0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRR29P0C7W0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRR29P0C7W0 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRR29P0C7W0 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRR29P0C7W0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRR29P0C7W0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRR29P0C7W0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRR29P0C7W0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRR29P0C7W0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRR29P0C7W0 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRR29P0C7W0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRR29P0C7W0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRR29P0C7W0 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRR29P0C7W0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRR29P0C7W0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRR29P0C7W0 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRR29P0C7W0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRR29P0C7W0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRR29P0C7W0 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRR29P0C7W0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRR29P0C7W0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRR29P0C7W0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRR29P0C7W0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRR29P0C7W0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRR29P0C7W0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRR29P0C7W0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRR29P0C7W0 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRR29P0C7W0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRR29P0C7W0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRR29P0C7W0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRR29P0C7W0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRR29P0C7W0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRR29P0C7W0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRR29P0C7W0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRR29P0C7W0 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRR29P0C7W0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRR29P0C7W0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRR29P0C7W0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRR29P0C7W0 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRR29P0C7W0 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRR29P0C7W0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRR29P0C7W0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRR29P0C7W0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRR29P0C7W0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRR29P0C7W0 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms