Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NGFRP08138 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NGFRP08138 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NGFRP08138 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NGFRP08138 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NGFRP08138 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NGFRP08138 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NGFRP08138 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NGFRP08138 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NGFRP08138 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NGFRP08138 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NGFRP08138 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NGFRP08138 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NGFRP08138 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NGFRP08138 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NGFRP08138 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NGFRP08138 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NGFRP08138 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NGFRP08138 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NGFRP08138 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NGFRP08138 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NGFRP08138 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NGFRP08138 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NGFRP08138 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NGFRP08138 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NGFRP08138 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NGFRP08138 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NGFRP08138 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NGFRP08138 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NGFRP08138 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NGFRP08138 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NGFRP08138 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NGFRP08138 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NGFRP08138 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NGFRP08138 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NGFRP08138 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NGFRP08138 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NGFRP08138 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NGFRP08138 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NGFRP08138 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NGFRP08138 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NGFRP08138 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NGFRP08138 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NGFRP08138 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NGFRP08138 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NGFRP08138 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NGFRP08138 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NGFRP08138 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NGFRP08138 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NGFRP08138 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NGFRP08138 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NGFRP08138 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NGFRP08138 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NGFRP08138 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NGFRP08138 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NGFRP08138 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NGFRP08138 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NGFRP08138 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NGFRP08138 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NGFRP08138 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NGFRP08138 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NGFRP08138 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NGFRP08138 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NGFRP08138 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NGFRP08138 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NGFRP08138 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NGFRP08138 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NGFRP08138 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NGFRP08138 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NGFRP08138 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NGFRP08138 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NGFRP08138 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NGFRP08138 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NGFRP08138 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NGFRP08138 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NGFRP08138 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NGFRP08138 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NGFRP08138 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NGFRP08138 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NGFRP08138 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NGFRP08138 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NGFRP08138 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NGFRP08138 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NGFRP08138 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NGFRP08138 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NGFRP08138 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NGFRP08138 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NGFRP08138 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NGFRP08138 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NGFRP08138 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NGFRP08138 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NGFRP08138 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NGFRP08138 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NGFRP08138 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NGFRP08138 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NGFRP08138 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NGFRP08138 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NGFRP08138 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NGFRP08138 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NGFRP08138 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms