Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHOP08100 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHOP08100 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHOP08100 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHOP08100 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHOP08100 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHOP08100 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHOP08100 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RHOP08100 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHOP08100 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHOP08100 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHOP08100 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHOP08100 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHOP08100 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHOP08100 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHOP08100 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHOP08100 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHOP08100 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHOP08100 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHOP08100 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHOP08100 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHOP08100 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHOP08100 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOP08100 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOP08100 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOP08100 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOP08100 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOP08100 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOP08100 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOP08100 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOP08100 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOP08100 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOP08100 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOP08100 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOP08100 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOP08100 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOP08100 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOP08100 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOP08100 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOP08100 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOP08100 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOP08100 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOP08100 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RHOP08100 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOP08100 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOP08100 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOP08100 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOP08100 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOP08100 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOP08100 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOP08100 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOP08100 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOP08100 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOP08100 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOP08100 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOP08100 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOP08100 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOP08100 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOP08100 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOP08100 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOP08100 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOP08100 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOP08100 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOP08100 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOP08100 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOP08100 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOP08100 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOP08100 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RHOP08100 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RHOP08100 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RHOP08100 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RHOP08100 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RHOP08100 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RHOP08100 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RHOP08100 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RHOP08100 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RHOP08100 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RHOP08100 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RHOP08100 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RHOP08100 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RHOP08100 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RHOP08100 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RHOP08100 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RHOP08100 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RHOP08100 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RHOP08100 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RHOP08100 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RHOP08100 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHOP08100 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHOP08100 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHOP08100 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHOP08100 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHOP08100 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHOP08100 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHOP08100 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHOP08100 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHOP08100 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHOP08100 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RHOP08100 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RHOP08100 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms