Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGB3P05106 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGB3P05106 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms