Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms