Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYNGR3O43761 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms