Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATCO43716 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATCO43716 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATCO43716 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATCO43716 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATCO43716 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATCO43716 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GATCO43716 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATCO43716 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATCO43716 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATCO43716 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GATCO43716 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATCO43716 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATCO43716 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATCO43716 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATCO43716 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATCO43716 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATCO43716 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATCO43716 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATCO43716 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATCO43716 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATCO43716 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GATCO43716 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATCO43716 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATCO43716 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATCO43716 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATCO43716 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATCO43716 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATCO43716 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATCO43716 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATCO43716 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATCO43716 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATCO43716 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATCO43716 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATCO43716 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATCO43716 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATCO43716 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATCO43716 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATCO43716 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATCO43716 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATCO43716 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATCO43716 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATCO43716 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATCO43716 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATCO43716 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATCO43716 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATCO43716 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATCO43716 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATCO43716 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATCO43716 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GATCO43716 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATCO43716 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATCO43716 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATCO43716 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATCO43716 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATCO43716 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATCO43716 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATCO43716 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATCO43716 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATCO43716 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATCO43716 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATCO43716 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GATCO43716 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATCO43716 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATCO43716 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATCO43716 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATCO43716 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATCO43716 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATCO43716 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATCO43716 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GATCO43716 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATCO43716 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATCO43716 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATCO43716 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATCO43716 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATCO43716 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATCO43716 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATCO43716 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATCO43716 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATCO43716 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATCO43716 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATCO43716 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATCO43716 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATCO43716 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATCO43716 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATCO43716 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATCO43716 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATCO43716 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATCO43716 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATCO43716 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATCO43716 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATCO43716 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATCO43716 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATCO43716 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATCO43716 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATCO43716 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATCO43716 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATCO43716 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATCO43716 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATCO43716 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms