Protein–RNA interactions for Protein: O43570

CA12, Carbonic anhydrase 12, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA12O43570 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CA12O43570 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CA12O43570 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CA12O43570 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CA12O43570 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CA12O43570 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CA12O43570 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CA12O43570 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CA12O43570 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CA12O43570 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CA12O43570 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CA12O43570 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CA12O43570 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CA12O43570 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CA12O43570 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CA12O43570 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CA12O43570 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CA12O43570 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CA12O43570 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CA12O43570 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CA12O43570 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CA12O43570 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CA12O43570 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CA12O43570 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CA12O43570 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CA12O43570 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CA12O43570 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CA12O43570 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CA12O43570 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CA12O43570 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CA12O43570 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CA12O43570 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CA12O43570 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CA12O43570 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CA12O43570 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CA12O43570 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CA12O43570 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CA12O43570 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CA12O43570 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CA12O43570 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CA12O43570 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CA12O43570 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CA12O43570 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CA12O43570 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CA12O43570 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CA12O43570 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CA12O43570 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CA12O43570 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CA12O43570 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CA12O43570 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CA12O43570 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CA12O43570 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CA12O43570 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CA12O43570 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CA12O43570 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CA12O43570 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CA12O43570 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CA12O43570 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CA12O43570 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CA12O43570 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CA12O43570 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CA12O43570 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CA12O43570 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CA12O43570 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CA12O43570 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CA12O43570 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CA12O43570 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CA12O43570 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CA12O43570 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CA12O43570 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CA12O43570 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CA12O43570 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CA12O43570 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CA12O43570 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CA12O43570 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CA12O43570 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CA12O43570 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CA12O43570 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CA12O43570 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CA12O43570 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CA12O43570 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CA12O43570 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CA12O43570 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CA12O43570 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CA12O43570 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CA12O43570 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CA12O43570 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CA12O43570 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CA12O43570 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CA12O43570 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CA12O43570 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CA12O43570 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CA12O43570 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CA12O43570 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CA12O43570 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CA12O43570 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CA12O43570 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CA12O43570 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CA12O43570 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CA12O43570 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms