Protein–RNA interactions for Protein: O15399

GRIN2D, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2D, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2DO15399 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GRIN2DO15399 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GRIN2DO15399 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms